DNA barcoding reveals overlooked shark and bony fish species in landing reports of small-scale fisheries from northern Peru

Authors

  • Alan Marín Laboratorio de Genética, Fisiología y Reproducción, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional del Santa, Av. Pacífico 508, Chimbote, Perú
  • Renato Gozzer-Wuest REDES - Sostenibilidad Pesquera, Calle Porta Nº 130, of. 608, 15074 - Lima, Perú
  • Jorge Grillo-Nuñez REDES - Sostenibilidad Pesquera, Calle Porta Nº 130, of. 608, 15074 - Lima, Perú
  • Irina B. Alvarez-Jaque Laboratorio de Genética, Fisiología y Reproducción, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional del Santa, Av. Pacífico 508, Chimbote, Perú
  • Juan Carlos Riveros OCEANA - Perú, Av. del Ejército 250, of. 302, Lima, Perú

DOI:

https://doi.org/10.47193/mafis.3522022010502

Keywords:

Smooth-hound, mitochondrial DNA, marine diversity, shark conservation, Mustelus

Abstract

Species-level identification of commercially landed fish provides pivotal information for stock assessment and fishery management. However, there is a common lack of species determination in landing records from small-scale fisheries (SSFs) worldwide. Using DNA barcoding analyses, we detected four overlooked bony fish (yellow snapper, union snook, blackspot wrasse, and steeplined drum) and one shark species (the sicklefin smooth-hound) in official landing records of SSFs from northern Peru. Of particular concern is the sicklefin smooth-hound shark Mustelus lunulatus that was found to be overlooked and could mistakenly be landed as the humpback smooth-hound M. whitneyi. Increased efforts should be made to improve species identification capacities in Peruvian fishing landings. There is an urgent need to quantify the catch levels of members of the genus Mustelus to species level. This would contribute to a better understanding of the levels of exploitation in each particular species and to improved management decisions.

Downloads

Download data is not yet available.

Metrics

Metrics Loading ...

Author Biographies

Alan Marín, Laboratorio de Genética, Fisiología y Reproducción, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional del Santa, Av. Pacífico 508, Chimbote, Perú

Renato Gozzer-Wuest, REDES - Sostenibilidad Pesquera, Calle Porta Nº 130, of. 608, 15074 - Lima, Perú

Jorge Grillo-Nuñez, REDES - Sostenibilidad Pesquera, Calle Porta Nº 130, of. 608, 15074 - Lima, Perú

Irina B. Alvarez-Jaque, Laboratorio de Genética, Fisiología y Reproducción, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional del Santa, Av. Pacífico 508, Chimbote, Perú

Juan Carlos Riveros, OCEANA - Perú, Av. del Ejército 250, of. 302, Lima, Perú

References

Amorós S, Gozzer R, Melgar, V, Rovegno N. 2017. Peruvian mahi mahi fishery (Coryphaena hippurus): characterization and analysis of the supply chain. WWF (Marine Program of WWF) Peru. http://d2ouvy59p0dg6k.cloudfront.net/downloads/mahi_mahi_value_chai_en.pdf.

Biffi D, López-Mobilia A, Kelez S, Williams DA, Chumchal MM, Weinburgh M. 2020. Mislabelling and high mercury content hampers the efforts of market-based seafood initiatives in Peru. Sci Rep. 10 (1): 1-12.

Cornejo R, Vélez-Zuazo X, González-Pestana A, Kouri C, Mucientes, G. 2015. An updated checklist of Chondrichthyes from the southeast Pacific off Peru. Check List. 11 (6): 1809.

De la Puente S, López De La Lama R, Benavente S, Sueiro JC, Pauly D. 2020. Growing into poverty: Reconstructing Peruvian small-scale fishing effort between 1950 and 2018. Front Mar Sci. 7, 681.

El Peruano. 2016. Decreto supremo que establece medidas de ordenamiento para la pesquería del recurso tiburón. 2 de noviembre del 2016. Decreto Supremo Nº 021-2016-PRODUCE; [accessed 2021 September 16]. https://elperuano.pe/normaselperuano/2016/11/02/1448564-3.html.

Elliott-Rodríguez W, Paredes-Bulnes, F, Zeballos-Flor J, Juárez L, Barreto-Meza J. 1996. Nomenclatura actualizada de peces comerciales del Perú. Informe Progresivo Nº 37. Inf Inst Mar Perú. 12 p.

Estrella-Arellano C, Guevara-Carrasco R. 1998a. Informe Nº 131. Informe estadístico anual de los recursos hidrobiológicos de la pesca artesanal por especies, artes, caletas y meses durante 1996. Inf Inst Mar Perú. p. 215.

Estrella-Arellano C, Guevara-Carrasco R. 1998b. Informe Nº 132. Informe estadístico anual de los recursos hidrobiológicos de la pesca artesanal por especies, artes, caletas y meses durante 1997. Inf Inst Mar Perú. p. 412.

Estrella-Arellano C, Guevara-Carrasco R, Avila-Pérez W, Palacios-León J, Medina-Cruz A. 2000. Informe Nº 151. Informe estadístico de los recursos hidrobiológicos de la pesca artesanal por especies, artes, meses y caletas durante el segundo semestre de 1999. Inf Inst Mar Perú. 151: 1-194.

Estrella-Arellano C, Guevara-Carrasco R, Palacios-León J, Avila-Pérez W, Medina-Cruz A. 1999. Informe Nº 148. Informe estadístico de los recursos hidrobiológicos de la pesca artesanal por especies, artes, meses y caletas durante el primer semestre de 1999. Inf Inst Mar Perú. p. 214.

[FAO] Food and Agriculture Organization of the United Nations. 2020. Illuminating Hidden harvests study in the spotlight at COFI virtual dialogues. Voluntary guidelines for securing sustainable small-scale fisheries in the context of food security and poverty eradication online 17/07/2020; [accessed 2021 September 16]. http://www.fao.org/voluntary-guidelines-small-scale-fisheries/news-and-events/detail/en/c/1300712/

Fernández-Ramírez F, Vera-Díaz S, Marcelo-Padilla R, Chirinos E. 2000. Estadísticas de los desembarques de la pesquería marina peruana 1999. Inf Inst Mar Perú. 115.

Flores M, Vera S, Marcelo R, Chirinos E. 1996. Estadísticas de los desembarques de la pesquería marina peruana durante 1995. Inf Prog Inst Mar Perú. 45. 35 p.

Flores-Palomino M, Vera-Díaz S, Marcelo-Padilla R, Chirinos E. 1994. Estadísticas de los desembarques de la pesquería marina Peruana 1983-1992. Inf Inst Mar Perú. 105. 202 p.

Gonzalez-Pestana A, Kouri C, Velez-Zuazo X. 2016. Shark fisheries in the Southeast Pacific: a 61-year analysis from Peru. F1000Res. 3.

Gozzer-Wuest R, Alonso-Población E, Tingley G. 2021. Identifying priority areas for improvement in Peruvian Fisheries. Mar Policy. 129, 104545.

Guevara-Carrasco R, Bertrand A, editors. 2017. Atlas de la pesca artesanal del mar del Perú. Lima: Edición IMARPE-IRD. 183 p.

[IMARPE] Instituto del Mar del Perú. 2015. Guía para la determinación de tiburones de importancia comercial en el Perú. Serie de divulgación científica. 1 (2). 80 p.

[IMARPE] Instituto del Mar del Perú. 2019. Respuesta a la solicitud de acceso a la información pública: información sobre estimados de desembarque de los principales recursos hidrobiológicos registrados por la pesquería artesanal en las caletas de Tumbes y Piura, durante los años 2014-2018. Carta Nº 073 2019-IMARPE/OGA. Inst Mar Perú. 18 p.

[IMARPE] Instituto del Mar del Perú. 2020. Respuesta a la solicitud de acceso a la información pública: información sobre estimados de desembarque de los principales recursos hidrobiológicos registrados por la pesquería artesanal en las caletas de Tumbes y Piura, durante los años 2010-2020. Oficios Nº 017, 018 y 019-2020-IMARPE/OGA. Inst. Mar Perú. 18 p.

[IMARPE] Instituto del Mar del Perú. 2021. Respuesta a la solicitud de acceso a la información pública: información sobre estimados de desembarque mensuales 2010-2020 en Piura y Tumbes de: Centropomus unionensis, Decodon melasma, Lutjanus argentiventris, Caulolatilus princeps, Pareques lanfeari, Larimus acclivis, Umbrina santi, Prionace glauca, Epinephelus analogus, Brotula ordwayi y Mustelus lunulatus. Oficios Nº 23 y 24-2021-IMARPE/OGA. Inst Mar Perú. 8 p.

Johnson GJ, Buckworth RC, Lee H, Morgan JAT, Ovenden JR, McMahon CR. 2017. A novel field method to distinguish between cryptic carcharhinid sharks, Australian blacktip shark Carcharhinus tilstoni and common blacktip shark C. limbatus, despite the presence of hybrids. J Fish Biol. 90 (1): 39-60.

Kelez S, Napuri RM, Pfennig AM, Martinez OC, Carrasco AT. 2020. First reports of Megamouth Shark, Megachasma pelagios Taylor, Compagno & Struhsaker, 1983 (Lamniformes, Megachasmidae), in Peru. Check List. 16: 1361.

Kumar S, Stecher G, Tamura K. 2016. MEGA7: molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol Biol Evol. 33 (7): 1870-1874.

López de la Lama R, De la Puente S, Riveros JC. 2018. Attitudes and misconceptions towards sharks and shark meat consumption along the Peruvian coast. PLoS ONE. 13 (8): e0202971.

Luque C. 2007. Estudio de la diversidad hidrobiologica en Tumbes. Informe Anual 2007. Tumbes: Inst Mar Perú. 36 p.

Marín A, Serna J, Robles C, Ramírez B, Reyes-Flores LE, Zelada-Mázmela E, Sotil G, Alfaro R. 2018. A glimpse into the genetic diversity of the Peruvian seafood sector: Unveiling species substitution, mislabeling and trade of threatened species. PLoS ONE. 13 (11): e0206596.

Medina-Morales SA, Corro-Espinosa D, Escobar-Sánchez O, Delgado-Alvarez CG, Ruelas-Inzunza J, Frías-Espericueta MG, et al. 2020. Mercury (Hg) and selenium (Se) content in the shark Mustelus henlei (Triakidae) in the northern Mexican Pacific. Environ Sci Pollut Res. 27 (14): 16774-16783.

Morgan A, Burgess GH. 2005. Fishery dependent sampling: total catch, effort and catch composition. In: Musick JA, Bonfil R, editors. Elasmobranch fisheries management techniques. FAO Tech Rep. 454. p. 182-200.

[NOAA] National Oceanic and Atmospheric Administration. 2020. International affairs. Shark conservation. https://www.fisheries.noaa.gov/national/international-affairs/shark-conservation.

Ocaño-Higuera VM, Marquez-Ríos E, Canizales-Dávila M, Castillo-Yáñez FJ, Pacheco-Aguilar R, Lugo-Sánchez ME, et al. 2009. Postmortem changes in cazon fish muscle stored on ice. Food Chem. 116 (4): 933-938.

Pastor R, Zavalaga F, Palacios J. 2018. Caracterización de la comunidad bentodemersal que cohabita con la merluza Merluccius gayi peruanus Ginsburg entre la frontera norte del dominio marítimo peruano y Huarmey. 2015. Inf Inst Mar Perú. 45 (1): 104-121.

Pedrosa-Gerasmio IR, Babaran RP, Santos MD. 2012. Discrimination of juvenile yellowfin (Thunnus albacares) and bigeye (T. obesus) tunas using mitochondrial DNA control region and liver morphology. PLoS ONE. 7 (4): e35604.

Pérez-Jiménez JC, Nishizaki OS, Castillo-Geniz JL. 2005. A new eastern North Pacific smooth-hound shark (genus Mustelus, family Triakidae) from the Gulf of California. Copeia. (4): 834-845.

Pérez-Jiménez J, White CF, Ruiz C, Carlisle AB, Lowe CG. 2016. Mustelus lunulatus. The IUCN Red List of Threatened Species 2016: e.T161640A80672480.

[PRODUCE] Ministerio de la Producción. 2020. Anuario estadístico pesquero y acuícola 2019. Lima: Ministerio de la Producción. 181 p.

Romero MA, Alcántara PF, Verde K, editors. 2015. Guía de campo para la determinación de tiburones en la pesca artesanal del Perú. Lima: Inst Mar Perú. 15 p.

Sambrook J, Rusell D. 2001. Molecular cloning: a laboratory manual. 3rd ed. New York: Cold Spring Harbor.

Velez-Zuazo X, Alfaro-Shigueto J, Mangel J, Papa R, Agnarsson I. 2015. What barcode sequencing reveals about the shark fishery in Peru. Fish Res. 161: 34-41.

Wosnitza-Mendo C, Espino M, Véliz M. 1988. La pesquería artesanal en el Perú durante junio de 1986 a junio de 1988. Inf Inst Mar Perú. 93. 142 p.

Published

2022-01-26

How to Cite

Marín, A., Gozzer-Wuest, R., Grillo-Nuñez, J., Alvarez-Jaque, I. B. and Riveros, J. C. (2022) “DNA barcoding reveals overlooked shark and bony fish species in landing reports of small-scale fisheries from northern Peru”, Marine and Fishery Sciences (MAFIS), 35(2), pp. 307–314. doi: 10.47193/mafis.3522022010502.

Most read articles by the same author(s)